Le samedi 21 septembre 2013, lors d'une rencontre avec les responsables professionnels de la Région Rhône-Alpes, Stéphane Le Foll, ministre de l'Agriculture, a annoncé que tous les bouquetins de plus de cinq ans seraient prélevés (abattus) avant les premières neiges.
Selon le degré de contamination des effectifs restants au printemps prochain, un second plan de prélèvement, partiel ou total, pourrait être alors déployé dans le massif du Bargy.
Compte tenu du risque « considérable » que font peser les bouquetins contaminés sur les élevages (via les alpages) et la filière fromagère du secteur, les Savoyards auraient souhaité qu'un plan d'éradication total soit appliqué dès cet automne. La commission nationale de protection de l'environnement avait cependant rendu un avis négatif à la mi-septembre.