Dans un communiqué commun de presse diffusé le 14 octobre 2015, Stéphane Le Foll et Emmanuel Macron annoncent le lancement d'une mission de l'Inspection générale des finances sur l'investissement dans les filières animales. Cela fait suite à une annonce du Premier ministre début septembre, lorsqu'il a augmenté les enveloppes prévues pour le soutien de l'Etat aux investissements dans les élevages et les abattoirs.
Les conclusions de cette mission sont attendues début 2016. Il s'agit d'établir « un diagnostic des soutiens publics à l'investissement existants, en prenant en compte les besoins de chaque filière et leurs objectifs stratégiques. Il s'attachera à identifier les points sur lesquels des investissements coordonnés entre financeurs et entre maillons de la filière permettront de redonner de la compétitivité aux filières animales françaises. »