Compte tenu du niveau de salissement important de beaucoup de parcelles, les céréales devraient faire l'objet d'un passage systématique par le séparateur.
Pourvu de grilles régulièrement nettoyées, cet équipement élimine une grande partie des impuretés (graines d'adventices, barbes, etc.). Ensuite, les grains entreposés à plat ou en cellule se conservent mieux grâce à une ventilation homogène.
Afin de connaître la qualité de la récolte, quelques centaines de grammes sont recueillies sur chaque benne à la sortie du séparateur. Après mélange, l'échantillon moyen peut faire l'objet d'analyses (calibrage, protéines, etc.).